پیش بینی بیوانفورماتیکی mirna های هدف گیرنده ژن های hbx و notch۱ در هپاتوسلولار کارسینوما ناشی از هپاتیت bمزمن

چکیده زمینه و هدف: هپاتوسلولار کارسینوما(hcc) سومین عامل اصلی مرگ ناشی از سرطان در سراسر جهان محسوب می شود. ویروس هپاتیت b و ژن hbx آن به واسطه تداخل در مسیرهای سیگنالینگ نقش بسیار مهمی در پیشرفت سرطان hcc دارند. هم چنین به دلیل عدم وجود علائم بالینی در مراحل اولیه‏ی ابتلا، ضرورت شناسایی مارکرهای اختصاصی با حساسیت بالا جهت شناسایی زود هنگام افراد مبتلا به hcc احساس می گردد. از سوی دیگر، با پیشرفت و توسعه علوم بیوانفورماتیک، امکان پیش‏ بینی انواع مختلفی از mirnaها و ژن‏های هدف این بیومارکرها به وجود آمده است. بدین ‏منظور، در این مطالعه با توجه به داده‏ های حاصل از نرم افزارهای بیوانفورماتیک با الگوریتم‏های مختلف، mirnaهای هدف گیرنده ژن‏های hbx و notch1 براساس بالاتر بودن امتیاز، اتصال مناسب با ژن هدف و تایید در نرم افزار های بیشتر انتخاب و معرفی گردیدند. مواد و روش‏ ها: ابتدا توالی ژن‏ های hbx و notch1 از سایت ncbi دریافت گردید و سپس با استفاده از نرم افزارهای بیوانفورماتیک targetscan، mirwalk ، mirbase ، miranda ، pictar ، mirvir و diana به بررسی و پیش‏گویی mirnaها پرداخته شد. یافته‏ ها: با توجه به امتیاز دهی توسط نرم افزار های بیوانفورماتیک و بالاتر بودن امتیاز و هدف گیری مناسب تر،mir-34a به عنوان هدف گیرنده ژن notch1 و mir-6510، mir-5193 و mir-214 به عنوان عوامل هدف گیرنده ژنhbx معرفی گردیدند. نتیجه‏ گیری: با توجه به نقش تومورساپرسوری mir-214 و mir-34a در انواع سرطان ها احتمالا بتوان از آن ها به عنوان استراتژی درمانی در تحقیقات سرطان استفاده کرد. هم چنین به نظر می رسد که mir-5193 یکی از مارکرهای اختصاصی در تشخیص سرطان hcc باشد.